More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0837 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0837  response regulator  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0958978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1326  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000300613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1551  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1417  response regulator  35.45 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1220  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 458 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  31.71 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 542 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  33.65 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0614  putative GAF sensor protein  42.67 
 
 		 622 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00376401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 678 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  35.29 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0606  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.74 
 
 		 622 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0571  putative GAF sensor protein  40.74 
 
 		 622 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  33.01 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 631 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 		 741 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  32.22 
 
 		 866 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0598  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.74 
 
 		 622 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  33.33 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  33.33 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 909 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  33.01 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  29.84 
 
 		 559 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.71 
 
 		 233 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  33.01 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 1002 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 461 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.11 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 265 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  33.98 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2539  response regulator receiver protein  22.86 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.745401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 456 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 455 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 557 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 877 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  32.04 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 803 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 470 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 867 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 813 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 639 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2748  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.86 
 
 		 542 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2298  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 452 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  30.43 
 
 		 733 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  25.81 
 
 		 571 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.28 
 
 		 907 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2344  response regulator receiver domain-containing protein  24.59 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1525  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 		 347 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2689  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 624 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1620  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0904485  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3771  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 455 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.22 
 
 		 932 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 		 513 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 789 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.69 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.56 
 
 		 1374 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 381 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 849 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.45 
 
 		 914 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 511 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 807 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.45 
 
 		 900 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.45 
 
 		 904 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0435  two component transcriptional regulator  31.21 
 
 		 253 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.583358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 732 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 981 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  29.63 
 
 		 676 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  36.71 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.43 
 
 		 457 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 379 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  27.72 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 		 923 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.39 
 
 		 969 aa  47  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>