More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1551 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1551  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  277  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0837  response regulator  34.21 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0958978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  37 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 473 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1522  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.99 
 
 		 461 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 528 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.17 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 470 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1220  response regulator receiver domain-containing protein  33.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2037  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0751  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.84 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.17 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1326  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000300613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.96 
 
 		 461 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.68 
 
 		 472 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1634  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1360  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.37 
 
 		 525 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 508 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0879  two component Fis family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 488 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000467826  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0638  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 453 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 416 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  34.12 
 
 		 516 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  31.25 
 
 		 337 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1826  histidine kinase  31.68 
 
 		 828 aa  52  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.881555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  36 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 509 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.63 
 
 		 465 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1417  response regulator  28.24 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1798  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 466 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.634231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  32.61 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1954 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 810 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1689 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  31.91 
 
 		 209 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  32.58 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2653  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.09 
 
 		 482 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  32.94 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.77 
 
 		 631 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 219 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  30.63 
 
 		 436 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  41.07 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 782 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  41.38 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.39 
 
 		 738 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.127866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 803 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  33.7 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  41.07 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  32.18 
 
 		 1334 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 452 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.48 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  31.46 
 
 		 430 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2539  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.745401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  31.16 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 932 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 750 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  29.41 
 
 		 1060 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 461 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  32 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0702  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 460 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  29.27 
 
 		 656 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.77 
 
 		 464 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 452 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2234  response regulator receiver domain-containing protein  34.38 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.59 
 
 		 466 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  32.97 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2009  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 463 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  29.79 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2039  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 476 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1428  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 460 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 379 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.72 
 
 		 447 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  32.71 
 
 		 786 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  31.07 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  30.85 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  35.56 
 
 		 992 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4333  nitrogen regulation protein NR(I)  32.99 
 
 		 469 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0614  putative GAF sensor protein  35.06 
 
 		 622 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00376401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.22 
 
 		 777 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  32.94 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  32.63 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4237  nitrogen regulation protein NR(I)  32.99 
 
 		 469 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4287  nitrogen regulation protein NR(I)  32.99 
 
 		 469 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0756679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4394  nitrogen regulation protein NR(I)  32.99 
 
 		 469 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  32.22 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 430 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>