64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3724 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  52.63 
 
 
286 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  52.63 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  88.78 
 
 
99 aa  174  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  36.89 
 
 
258 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.28 
 
 
246 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  40.67 
 
 
242 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  38.42 
 
 
247 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40.53 
 
 
242 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  37.89 
 
 
242 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  37.77 
 
 
255 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.17 
 
 
241 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  38.86 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  39.91 
 
 
261 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  37.11 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  37 
 
 
260 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  34.35 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  36.99 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  36.99 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  36.02 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  36.02 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  36.53 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  36.02 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  36.02 
 
 
253 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  36.02 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.45 
 
 
253 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  32.72 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  36.28 
 
 
252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  35.45 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  40.57 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  35.26 
 
 
250 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  37.44 
 
 
251 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.41 
 
 
248 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  42.52 
 
 
271 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  28.74 
 
 
273 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  42.52 
 
 
271 aa  101  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  42.52 
 
 
223 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.35 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  30.89 
 
 
290 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  43.24 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  30.13 
 
 
276 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  44.14 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.44 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.79 
 
 
223 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  29.96 
 
 
277 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  26.29 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  31.46 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  32.27 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  41.8 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  33.51 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  33.8 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.28 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.3 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  38.52 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  42.06 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.53 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  27.7 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.53 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.27 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.72 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  26.29 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.9 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  34.33 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3468  PAP2 superfamily protein  22.73 
 
 
145 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>