62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0525 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  71.91 
 
 
286 aa  349  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  52.63 
 
 
231 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  37.17 
 
 
258 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.82 
 
 
246 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  36.67 
 
 
262 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  35.5 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  37.16 
 
 
253 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  37.16 
 
 
253 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  38.32 
 
 
256 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  39.25 
 
 
264 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  38.79 
 
 
256 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  38.79 
 
 
256 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  36.7 
 
 
253 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.75 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  33.74 
 
 
263 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  32.55 
 
 
247 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  34.51 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  35.24 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  32.98 
 
 
242 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  36.64 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.92 
 
 
242 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  32.14 
 
 
255 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  36.24 
 
 
251 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  35.71 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  36.04 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  32.73 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  35.53 
 
 
252 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.52 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  28.65 
 
 
271 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  29.17 
 
 
271 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  29.02 
 
 
223 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  31.06 
 
 
250 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  49.48 
 
 
99 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.08 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  33.91 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.34 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  28.02 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  26.54 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  25.13 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.1 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.48 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39.8 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  24.89 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  23.14 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.16 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  34.39 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  26.51 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.89 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  34.02 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  26.64 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.06 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39.6 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  38.14 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  29.59 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  31.93 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.92 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  29.38 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  34.62 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  26.29 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.38 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>