61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2994 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  53.81 
 
 
261 aa  248  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  52.36 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  55.5 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  55.05 
 
 
252 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  44.34 
 
 
253 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  39.47 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  34.52 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  37.77 
 
 
231 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  34.32 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  36.73 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  35.29 
 
 
253 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  35.19 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  35.48 
 
 
256 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  35.29 
 
 
253 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  32.14 
 
 
256 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  36.62 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.55 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  36 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  34.98 
 
 
264 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.72 
 
 
241 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  32.07 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  28 
 
 
258 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  31.13 
 
 
247 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  29.8 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.84 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  29.84 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.71 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.1 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  30.85 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  35.62 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  36.3 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  37.04 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  34.12 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.02 
 
 
242 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  32.8 
 
 
226 aa  86.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40.87 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  32.49 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  41.44 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40.54 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  37.12 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.29 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.23 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  36.22 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  34.09 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  33.33 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  34.88 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  31.06 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  30.68 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  40.34 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.53 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  43.37 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  25.24 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  26 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.09 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  41.67 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  23.03 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.67 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>