40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1885 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  100 
 
 
329 aa  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2064  PAP2 family protein  30.65 
 
 
305 aa  143  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0267151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.1 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.95 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  29.69 
 
 
287 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
249 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  21.02 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 
224 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  40.28 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.87 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  31.03 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.56 
 
 
249 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  31.03 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  30.5 
 
 
227 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  36.56 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
178 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.41 
 
 
267 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.67 
 
 
255 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  22.6 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  28.7 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
252 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.41 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.94 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.51 
 
 
271 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  29.91 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  23.03 
 
 
255 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.09 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1018  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.46 
 
 
220 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.67 
 
 
255 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.14 
 
 
273 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.64 
 
 
258 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.33 
 
 
331 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  28.3 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>