59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0733 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  51.13 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  50.68 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  50.68 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  50.68 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  50.85 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  50.85 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  51.29 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  48.31 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  45.05 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  43.84 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  44.8 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  41.79 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  41.2 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  41.2 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  39.47 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  33.62 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  36.24 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.94 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  34.3 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.06 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  33.78 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.5 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  37.11 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.64 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  30.23 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.52 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  30.11 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  32.2 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  34.22 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.06 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  34.03 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.59 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.76 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  32.03 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40.16 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  32.37 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  28.63 
 
 		 276 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.61 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  33.76 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  29.63 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.86 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  34.88 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  34.88 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  34.62 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  25.97 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  28.48 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  34.98 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  33.57 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.35 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  26.72 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  35 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.04 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  28.57 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.61 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.06 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  35.82 
 
 		 99 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>