61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  88.64 
 
 
263 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  59.07 
 
 
258 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.13 
 
 
246 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  54.07 
 
 
247 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  57.08 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  59.28 
 
 
242 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  59.28 
 
 
242 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  55.04 
 
 
242 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.16 
 
 
253 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  38.86 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  34.65 
 
 
256 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  33.19 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  35.68 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  32.76 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  32.76 
 
 
253 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  34.57 
 
 
262 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  32.76 
 
 
253 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  34.38 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  33.94 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  33.33 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  30.13 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  32.6 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.69 
 
 
258 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40 
 
 
248 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  33.33 
 
 
271 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  31.28 
 
 
256 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  31.28 
 
 
256 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  30.8 
 
 
255 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.65 
 
 
242 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  31.53 
 
 
252 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  32.84 
 
 
252 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  33.16 
 
 
232 aa  98.6  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  28.14 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  28.5 
 
 
226 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  27.49 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  31.54 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  30.08 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.35 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.4 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  28.45 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.25 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  29.87 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  33.5 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  31.21 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  35.1 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.3 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.76 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.68 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  29.22 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  37.3 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.42 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.02 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.9 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  32.86 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.55 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  25.51 
 
 
227 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>