60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3222 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  44.4 
 
 
253 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  43.98 
 
 
253 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  43.98 
 
 
253 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  43.98 
 
 
253 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  42.31 
 
 
264 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  43.62 
 
 
256 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  43.62 
 
 
256 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  43.62 
 
 
256 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  36.75 
 
 
260 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  43.38 
 
 
250 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  38.03 
 
 
253 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  38.37 
 
 
261 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  36.67 
 
 
256 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  36.44 
 
 
252 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  34.02 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  36.44 
 
 
252 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.47 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  35.83 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  34.52 
 
 
255 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.55 
 
 
258 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  34.09 
 
 
264 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  35.9 
 
 
231 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  32.62 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  30.77 
 
 
242 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  31.84 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.18 
 
 
241 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.17 
 
 
242 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.37 
 
 
248 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.17 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.1 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.51 
 
 
223 aa  89  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.31 
 
 
258 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  30.85 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  30.08 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  33.57 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  26.15 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  33.57 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  27.88 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  33.57 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.6 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  29.17 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.6 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  24.46 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  31.52 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  31.34 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  32.02 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.98 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  29.93 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  24.89 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  29.38 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.78 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.48 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  30.08 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  25.56 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.29 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.98 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  34.21 
 
 
99 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>