58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1044 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  52.38 
 
 
239 aa  240  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  51.91 
 
 
239 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  34.23 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.44 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  27.47 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  26.83 
 
 
258 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.15 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  27.36 
 
 
263 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.5 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  29.28 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  28.25 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3468  PAP2 superfamily protein  34.31 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.4 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  25.38 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  27.35 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  27.35 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  32.39 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  27.85 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  26.21 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.04 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  31.54 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  31.54 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  26.95 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  28.99 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  34.48 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  35.88 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  31.69 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  33.06 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  28.5 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  33.61 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  35.54 
 
 
271 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  27.87 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  35.54 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.59 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  28.35 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  31.54 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  35.54 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  25.93 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  23.79 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  31.4 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  27.41 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  25.71 
 
 
233 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  29.53 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  25.97 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  30.77 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  29.92 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  29.37 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.23 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  29.22 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  27.66 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  35.24 
 
 
248 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  26.77 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  29.06 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.09 
 
 
329 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  33.06 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>