61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2650 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  99.26 
 
 
271 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  98.65 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  72.46 
 
 
250 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  56.71 
 
 
242 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.96 
 
 
258 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.7 
 
 
246 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  34.9 
 
 
264 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  34.38 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.87 
 
 
241 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  31.79 
 
 
242 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  28.38 
 
 
256 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  31.98 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.77 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  32.43 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  41.41 
 
 
253 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  41.41 
 
 
253 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  34.74 
 
 
231 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  41.41 
 
 
253 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  45.87 
 
 
253 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  28.96 
 
 
286 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  36.11 
 
 
264 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  41.53 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  48.51 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.13 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  41.96 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  41.96 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.22 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  34.94 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  40.17 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  29.02 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  40.34 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.84 
 
 
233 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.72 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  32.51 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  29.05 
 
 
226 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  43.75 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  29.2 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  30.69 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  30.69 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  26.96 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  31.82 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  28.09 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  34.22 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.22 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  41.07 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  43.55 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  40.38 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  29.41 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  41.03 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.1 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  43.14 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  37.89 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.94 
 
 
224 aa  63.5  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.54 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  26.26 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  33.66 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  33.67 
 
 
239 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  29.1 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.67 
 
 
262 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>