50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2373 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  91.47 
 
 		 272 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  66.5 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  56.25 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  58.79 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  58.54 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  35.56 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.39 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  29.47 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.01 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  31.74 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  31.67 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.22 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  26.96 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.96 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  29.44 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.23 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  31.98 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  26.29 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  44.05 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  29.57 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  30.72 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  36 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  26.9 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  28.93 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  25.4 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  25.4 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  25.4 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  26.77 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  28.42 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  32.5 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  36.26 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  35.92 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  24.6 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  32.59 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  23.81 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  32.61 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  28.65 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  36.05 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  36.05 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3468  PAP2 superfamily protein  29.22 
 
 		 145 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  24.14 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.77 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.08 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.5 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>