61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2559 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  91.47 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  67.03 
 
 		 277 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  58.36 
 
 		 273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  58.97 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  59.61 
 
 		 276 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  29.39 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.8 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  32.8 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  31.43 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  31.39 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.43 
 
 		 242 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  27.27 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  31.46 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  31.49 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  26.16 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  30 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  37.1 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.67 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  26.84 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.87 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  27.83 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  26.02 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  27.83 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  27.83 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  26.23 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  28.51 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  31.06 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  26.47 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  28.38 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  28.38 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  30.71 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  27.66 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  36.29 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  31.51 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  28.38 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.58 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  24.7 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.6 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  36.22 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  32.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  37.4 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.93 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.88 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  36.04 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.71 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.71 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.33 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.59 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.33 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  29.06 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  36.67 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  34.35 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  28.81 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>