58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3284 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  100 
 
 
242 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  55.9 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  57.21 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  53.88 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  53.4 
 
 
233 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  53.02 
 
 
282 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  55.5 
 
 
223 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  50.45 
 
 
248 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  49.37 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  44.57 
 
 
239 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  44.56 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.71 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  35.32 
 
 
253 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  34.36 
 
 
253 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  34.36 
 
 
253 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  36.63 
 
 
253 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.6 
 
 
246 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  37.61 
 
 
261 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  30.04 
 
 
264 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  34.18 
 
 
253 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.02 
 
 
253 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  36.06 
 
 
252 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  31.17 
 
 
247 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  35.58 
 
 
252 aa  98.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  30.47 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  30.47 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  32.88 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  34.22 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.75 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.75 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  31.72 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  34.04 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  34.18 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  41.8 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  33.66 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  37.84 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  35.96 
 
 
251 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.64 
 
 
248 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  31.43 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  37.3 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  40.31 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  32.73 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.75 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  35.48 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  28.93 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  29.41 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  29.57 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  29.37 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  28.39 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.5 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  32.08 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  29.29 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  26.99 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.5 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.67 
 
 
278 aa  57  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  33.68 
 
 
239 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>