57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3592 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  48.85 
 
 
253 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  48.66 
 
 
253 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  48.85 
 
 
253 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  48.39 
 
 
253 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  43.38 
 
 
262 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  45.05 
 
 
251 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  47.39 
 
 
256 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  46.19 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  46.19 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  44.21 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  37.83 
 
 
260 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  39.73 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  41.55 
 
 
261 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  38.84 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  35.47 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  35.09 
 
 
253 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  34.68 
 
 
286 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.95 
 
 
241 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.1 
 
 
253 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  28.94 
 
 
256 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  28.36 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  32.82 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  27.57 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  30.06 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.71 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  29.05 
 
 
247 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.25 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  34.48 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  37.11 
 
 
239 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  28.71 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.17 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  27.16 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  28.32 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  28.63 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  28.79 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  28.27 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  33.12 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  31.06 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  29.61 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  32.45 
 
 
290 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.58 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.9 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  27.14 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  33.71 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.67 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.41 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  37.89 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  32.84 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  37.89 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.75 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  37.89 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  34.76 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  30.83 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.61 
 
 
267 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.69 
 
 
278 aa  62  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.93 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>