61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0661 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  94.53 
 
 		 256 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  80.08 
 
 		 264 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  77.64 
 
 		 253 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  78.05 
 
 		 253 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  77.64 
 
 		 253 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  76.42 
 
 		 253 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  42.75 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  50.85 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  46.19 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  37.39 
 
 		 286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  38.79 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  42.63 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  36.7 
 
 		 253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  42.5 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  39.25 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  38.79 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.19 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  35.48 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  36.55 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  33.18 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  34.96 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  33.68 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  33.01 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.69 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  32.32 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.79 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.19 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  30.89 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  34.1 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  38.58 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  41.96 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.74 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  41.96 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  40.52 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.79 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  38.33 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  35.76 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.66 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.61 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.43 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  34.43 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.15 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  25.2 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  28.62 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  28.21 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  32 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  33.15 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  28.38 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39.62 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  26.07 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.67 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  26.57 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.4 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  34.41 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.11 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  32.8 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  27.96 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  28.85 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>