63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4071 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  88.98 
 
 
247 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  66.67 
 
 
258 aa  358  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  69.23 
 
 
242 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  70.14 
 
 
242 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  67.53 
 
 
242 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  55.37 
 
 
263 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  54.13 
 
 
264 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.5 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.42 
 
 
253 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  39.3 
 
 
286 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  39.38 
 
 
231 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  35.82 
 
 
256 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  37.44 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  33.47 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  37.16 
 
 
253 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  36.7 
 
 
253 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  36.7 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  34.27 
 
 
264 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  33.62 
 
 
256 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  34.06 
 
 
256 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  34.06 
 
 
256 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  32.39 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  34.5 
 
 
277 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  32.55 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  31.8 
 
 
261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  32.35 
 
 
271 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  30.9 
 
 
273 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  31.86 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  31.86 
 
 
223 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  32.62 
 
 
276 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  31.94 
 
 
251 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.88 
 
 
242 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.12 
 
 
248 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  29.95 
 
 
252 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  32.77 
 
 
290 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.14 
 
 
258 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  29.95 
 
 
252 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  29.89 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  30.09 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  30.15 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  27.23 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.16 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.39 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  31.16 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  30.59 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.15 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.47 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.83 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.73 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  32.46 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  28.11 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  30.21 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.64 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  23.4 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.41 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  24.66 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.05 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  33.75 
 
 
99 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  24.44 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  26.52 
 
 
442 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>