61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0660 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  94.53 
 
 
256 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  94.53 
 
 
256 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  81.67 
 
 
264 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  77.55 
 
 
253 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  77.96 
 
 
253 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  76.19 
 
 
253 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  75.4 
 
 
253 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  43.62 
 
 
262 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  51.29 
 
 
251 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  47.39 
 
 
250 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  36.09 
 
 
286 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  38.32 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  41.58 
 
 
260 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  37.61 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  40.5 
 
 
261 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  39.25 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.57 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  38.79 
 
 
252 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.62 
 
 
246 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.8 
 
 
258 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  36.04 
 
 
231 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  36 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  34.82 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  34.74 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  35.14 
 
 
264 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.15 
 
 
242 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  32.32 
 
 
242 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  35.26 
 
 
232 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.74 
 
 
258 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.65 
 
 
248 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  30.37 
 
 
242 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  38.58 
 
 
250 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  41.53 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.59 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  41.53 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.52 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  41.53 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.17 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  36.03 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  36.67 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.46 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.21 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  29.74 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.97 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  33.88 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  24.91 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  30.5 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  30 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  31.67 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  25.95 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40.78 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  28.38 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.06 
 
 
278 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.19 
 
 
229 aa  62  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  25.44 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.09 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  34.41 
 
 
99 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  32.23 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  26.88 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  28.48 
 
 
227 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>