61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1855 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  498  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  99.21 
 
 		 252 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  61.43 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  56.02 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  48.67 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  51.36 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  36.44 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  41.2 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  37.22 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  36.48 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  37.22 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  36.77 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  38.57 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  35.18 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  37.67 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  37.67 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  37.44 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  35.53 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  36.27 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  29.96 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  32.18 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.18 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.92 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.33 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  32.84 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  29.67 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.18 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  30.29 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  30.7 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.8 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.15 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  38.52 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  29.9 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39.2 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  28.64 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.03 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  30.34 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  30.69 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  30.69 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  30.69 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  28.51 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  32 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  29.58 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  32.89 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.75 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  35.77 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  32.52 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  35.58 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.54 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.91 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  40 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  40.71 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  42.74 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  30.36 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3468  PAP2 superfamily protein  26.36 
 
 		 145 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.14 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.01 
 
 		 229 aa  45.4  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  27.12 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>