14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3468 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3468  PAP2 superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  31.43 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.31 
 
 		 278 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  30.5 
 
 		 239 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  30.66 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  27.52 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  24.84 
 
 		 273 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  28.77 
 
 		 255 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  23.91 
 
 		 253 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  27.62 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  27.34 
 
 		 260 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 253 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  23.88 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  25.2 
 
 		 286 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>