60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04471 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  60.81 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  53.81 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  61.43 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  53.18 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  46.76 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  38.37 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  44.8 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  42.2 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  43.65 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  43.65 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  38.11 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  40.74 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  42.5 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  42.5 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  40.5 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  41.21 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  41.05 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  36.64 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  40.18 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  32.99 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.05 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.8 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.84 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  32.7 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  29.9 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  30.93 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  31.16 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.31 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  36.65 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  33.5 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  38.4 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  38.4 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  37.69 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.64 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39.77 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  36.07 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  29.69 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  36.84 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  29.05 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  26.81 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  25.68 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  39.31 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  24.25 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  42.73 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  40.91 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  35.32 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  37.25 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  24.7 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  33.33 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  29.05 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  42.2 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  28.92 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  34.27 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.67 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  25.76 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.13 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.66 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  29.9 
 
 		 99 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>