59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3625 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 262 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  34.36 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.32 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.71 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.68 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  32.39 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.6 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.72 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.99 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.18 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.04 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.61 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.69 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.86 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  30.3 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.09 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.82 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.08 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  35.77 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  36.11 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.05 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  27.27 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  24.87 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3031  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.1 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  33.62 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.43 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  31.69 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.76 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.19 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  34.71 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.57 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  39.19 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2064  PAP2 family protein  29.75 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0267151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.78 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  24.24 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  29.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  35.92 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.97 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  31.9 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  30.39 
 
 		 299 aa  45.8  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  39.47 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  34.41 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.14 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  39.47 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.61 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1538  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.54 
 
 		 469 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.819522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.65 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  32.67 
 
 		 215 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.01 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  33.66 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1249  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.22 
 
 		 489 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.195733  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  30 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  30.1 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  30.1 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0214  PAP2 superfamily domain-containing protein  24.56 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.69 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  31.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>