22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0712 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  78.91 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  68.75 
 
 		 262 aa  367  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  68.87 
 
 		 262 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  68.6 
 
 		 259 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  71.55 
 
 		 261 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  70.75 
 
 		 262 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.43 
 
 		 281 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.54 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  32.35 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.22 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.95 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.83 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.9 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  29.44 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.1 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.31 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.94 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  31.9 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.83 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  29.03 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>