22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0239 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  75 
 
 		 262 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  75.61 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  68.85 
 
 		 258 aa  344  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  69.23 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  64.37 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  66.53 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.65 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.09 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.61 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  34.02 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.15 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.34 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.75 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  31.09 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.14 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.14 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  29.01 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.7 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  24.19 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.49 
 
 		 241 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>