20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0398 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  88.19 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  68.6 
 
 		 258 aa  347  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  66.67 
 
 		 262 aa  340  9e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  66.54 
 
 		 262 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  71.81 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  66.53 
 
 		 261 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.09 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.68 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.87 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  34.01 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.7 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.9 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  26.24 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.58 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.09 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.26 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.8 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  33.06 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  29.93 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>