26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3479 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
255 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  35.58 
 
 
227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.21 
 
 
223 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.95 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  49.47 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.7 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.7 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  38.39 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.97 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  30.14 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.58 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.1 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.98 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.72 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.87 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.03 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.94 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.8 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  33.1 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.11 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.65 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1885  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.67 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  37.33 
 
 
359 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 
359 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  38.95 
 
 
178 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  36.63 
 
 
268 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>