More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4760 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
279 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  55.73 
 
 
280 aa  257  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.42 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.67 
 
 
273 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  37.06 
 
 
266 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  35.33 
 
 
296 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  35.67 
 
 
812 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.88 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.43 
 
 
261 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.73 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
198 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.82 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.54 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  36.11 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.33 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.21 
 
 
182 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.82 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.45 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 
182 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  38.74 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.55 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.82 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.35 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.35 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.64 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  39.58 
 
 
200 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.58 
 
 
200 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.6 
 
 
172 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.8 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.04 
 
 
169 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  36.45 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  30.56 
 
 
358 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.02 
 
 
201 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.02 
 
 
201 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.72 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.23 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.75 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.17 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  35.19 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.94 
 
 
222 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.57 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.38 
 
 
199 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.9 
 
 
230 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.25 
 
 
157 aa  59.3  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.37 
 
 
222 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
178 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
178 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.19 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.45 
 
 
171 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.55 
 
 
185 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.34 
 
 
205 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
185 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.25 
 
 
178 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.25 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  38.53 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.18 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.62 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.86 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  35.42 
 
 
170 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  38.53 
 
 
204 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.4 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.67 
 
 
199 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.25 
 
 
179 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  35.63 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.95 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.45 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.4 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.97 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  33.33 
 
 
171 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  28.33 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  27.81 
 
 
199 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.03 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  28.14 
 
 
220 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0484  hypothetical protein  33.79 
 
 
223 aa  52.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.35 
 
 
248 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.09 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.76 
 
 
439 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.09 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  32.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.53 
 
 
198 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  35.4 
 
 
204 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.35 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  31.03 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.53 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.17 
 
 
378 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.46 
 
 
499 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  35.4 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  35.4 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>