159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7169 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7169  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.117092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.98 
 
 		 484 aa  84.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  35.44 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  42.11 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.42 
 
 		 285 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  34.45 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.45 
 
 		 462 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  36.44 
 
 		 465 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 456 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  33.88 
 
 		 596 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.62 
 
 		 462 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  43.68 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  41.46 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  41.49 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  58.7 
 
 		 499 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 460 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  41.94 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  47.3 
 
 		 449 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  53.03 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.25 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  33.61 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  51.79 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  32.17 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.4 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  45.95 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.08 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  52.63 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  42.68 
 
 		 473 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  51.61 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  54.55 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  50 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  65.79 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  50.77 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  41.98 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  38.32 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  27.97 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  34.71 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  50.79 
 
 		 288 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  38.38 
 
 		 295 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  55.1 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  56.82 
 
 		 446 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  33.9 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  56.1 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.13 
 
 		 465 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.35 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  31.36 
 
 		 474 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  45.59 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.06 
 
 		 464 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  51.06 
 
 		 456 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  40.28 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 		 473 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  31.19 
 
 		 460 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  63.16 
 
 		 463 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  53.06 
 
 		 462 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  58.14 
 
 		 466 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.87 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  58.54 
 
 		 479 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  37.35 
 
 		 328 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  46.97 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  51.02 
 
 		 462 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.5 
 
 		 465 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  47.73 
 
 		 448 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  48.94 
 
 		 456 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 		 462 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 468 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  43.66 
 
 		 281 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  63.16 
 
 		 465 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  45.45 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 		 467 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  47.69 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  40.28 
 
 		 309 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  50.85 
 
 		 468 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  40.85 
 
 		 460 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  43.55 
 
 		 441 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  36.04 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.11 
 
 		 307 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  26.05 
 
 		 473 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 		 444 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  34.69 
 
 		 460 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2283  luciferase family protein  49.06 
 
 		 296 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  41.54 
 
 		 291 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  40.28 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  36.47 
 
 		 478 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  38.67 
 
 		 476 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  33.67 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.88 
 
 		 451 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  48.84 
 
 		 758 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10402  FAD-binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03300)  31.88 
 
 		 500 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0469697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3907  luciferase-like protein  45.61 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  44.62 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3981  luciferase family protein  45.61 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4383  luciferase family protein  44.07 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.722636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3922  luciferase family protein  45.61 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  45.83 
 
 		 439 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  62.86 
 
 		 466 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>