More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4383 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4383  luciferase family protein  100 
 
 
291 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.722636  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2283  luciferase family protein  82.65 
 
 
296 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3907  luciferase-like protein  78.55 
 
 
293 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3981  luciferase family protein  78.55 
 
 
293 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389653  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3922  luciferase family protein  78.55 
 
 
293 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4364  luciferase-like protein  70.1 
 
 
291 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.390419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4152  hypothetical protein  61 
 
 
201 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  33.79 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3229  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.22 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.6 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.4 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  31.34 
 
 
341 aa  85.5  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  36.3 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  28 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  36.89 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  34.27 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  35.38 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  28.37 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.51 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  29.84 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  29.84 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  29.84 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  35.71 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  28.46 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  35.97 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  24.91 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  35.12 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.04 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  25.19 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  34.59 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  31.95 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  35.34 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  33.93 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  33.93 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  33.93 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  30.11 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  33.99 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.2 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  35.25 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  26.25 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  32.97 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  34.06 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.14 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.94 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  34.52 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.71 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.57 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  36.13 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  37.24 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  34.39 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  33.13 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.82 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.64 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  30.69 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  33.73 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0532  luciferase-like protein  29.63 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.19 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  38.14 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  32.03 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  30.2 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  32.93 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  32.17 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  31.4 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.73 
 
 
354 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  29.17 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  39.09 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  35 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.57 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  33.59 
 
 
361 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  28.68 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  32.37 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  29 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  28.49 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  29.09 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  25.28 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  24.91 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  29 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  30.94 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.92 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  30.41 
 
 
358 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  33.06 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  32.68 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  29 
 
 
351 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.52 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.52 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.96 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  34.68 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
343 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  34 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  27.13 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  34 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>