More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3907 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3907  luciferase-like protein  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3981  luciferase family protein  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389653  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3922  luciferase family protein  99.32 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4383  luciferase family protein  78.55 
 
 
291 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.722636  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4364  luciferase-like protein  72.16 
 
 
291 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.390419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2283  luciferase family protein  76.87 
 
 
296 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4152  hypothetical protein  60 
 
 
201 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  35.49 
 
 
282 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3229  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.11 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.11 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.62 
 
 
285 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.95 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  30.91 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.51 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.68 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  27.89 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.51 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.64 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  37.35 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  27.68 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  25.16 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.33 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  32.89 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.64 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  35.25 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  25.37 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  35.38 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.23 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  27.86 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  35.15 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  32.54 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  35.15 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  35.15 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  36.13 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  35.25 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.51 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  35.76 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  33.14 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.69 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.75 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.69 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.69 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.09 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  30.67 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  29.38 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  37.3 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  26.44 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  33.73 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  35.48 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  34.57 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  32.02 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  33.76 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  33.99 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.33 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  32.17 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  37.93 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  34.06 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  34.78 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  35.15 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.21 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  28.35 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.87 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.11 
 
 
360 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  25.67 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.38 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30.64 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.26 
 
 
354 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  26.19 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  29.2 
 
 
320 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  30.89 
 
 
293 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  29.51 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
358 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  28.72 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.26 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  32.81 
 
 
361 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  27.61 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  34.65 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  35.25 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.81 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>