191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4413 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  746    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  67.53 
 
 		 321 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  44.18 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  44.25 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  42.49 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  42.61 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  42.03 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  44.38 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  43.25 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  43.69 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  40.78 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  41.8 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  40.18 
 
 		 275 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  36.65 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  38.63 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  36.99 
 
 		 276 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  34.77 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  34.05 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  37.39 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  35.4 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 931 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  56.41 
 
 		 921 aa  53.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  48.89 
 
 		 909 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 931 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  62.5 
 
 		 900 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 934 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 934 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 934 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 915 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 936 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 921 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 930 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 893 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  51.06 
 
 		 953 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 921 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 936 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 936 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 903 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 897 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  44.9 
 
 		 914 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21380  SEC-C motif-containing protein  53.12 
 
 		 665 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  45.1 
 
 		 914 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 939 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  65.22 
 
 		 1118 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2505  preprotein translocase, SecA subunit  43.1 
 
 		 981 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  69.57 
 
 		 903 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  65.22 
 
 		 906 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  51.85 
 
 		 980 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 912 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0287  preprotein translocase subunit SecA  53.12 
 
 		 964 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.196625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  65.22 
 
 		 923 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  44.9 
 
 		 954 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 910 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  43.9 
 
 		 844 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 904 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  66.67 
 
 		 902 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  38.1 
 
 		 944 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 909 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  68.18 
 
 		 909 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0152  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 899 aa  46.6  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 896 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 		 1067 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  40.38 
 
 		 917 aa  46.6  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  52.94 
 
 		 917 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 884 aa  46.6  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 916 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 913 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  63.64 
 
 		 896 aa  46.2  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 924 aa  46.2  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  68.18 
 
 		 962 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 907 aa  46.2  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 930 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 911 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 908 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 907 aa  46.2  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 909 aa  46.2  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 907 aa  46.2  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0685  preprotein translocase, SecA subunit  56.67 
 
 		 931 aa  46.2  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 949 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 		 1004 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 916 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 916 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 908 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 		 962 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>