20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0259 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  60.73 
 
 
275 aa  320  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  55.11 
 
 
274 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  54.64 
 
 
278 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  54.28 
 
 
299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  52.81 
 
 
327 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  46.84 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  42.76 
 
 
308 aa  211  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  41.54 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  41.39 
 
 
312 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  42.91 
 
 
311 aa  181  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  42.12 
 
 
295 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  38.69 
 
 
292 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  39.8 
 
 
321 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  41.91 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  38.04 
 
 
314 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  37.69 
 
 
318 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  33.74 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  31.49 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  32.96 
 
 
298 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>