20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0374 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  54.28 
 
 
274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  59.71 
 
 
274 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  52.55 
 
 
275 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  52.75 
 
 
278 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  50.38 
 
 
327 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  49.07 
 
 
276 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  45.48 
 
 
308 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  45.51 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  45.95 
 
 
295 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  44.26 
 
 
312 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  45.51 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  49.45 
 
 
311 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  44.53 
 
 
292 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  44 
 
 
314 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  40.62 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  39.6 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  38.89 
 
 
390 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  33.88 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  35.64 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>