149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0240 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 327 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  54.6 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  52.81 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  51.36 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  50 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  52.21 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  46.34 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  48.34 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  50.38 
 
 		 299 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  50.37 
 
 		 278 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  45 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  49.25 
 
 		 275 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  45.32 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  47.37 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  44.06 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  46.82 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  42.33 
 
 		 390 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  45.02 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  41.23 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  39.31 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 931 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 931 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 931 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 930 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 931 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 931 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 931 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 931 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  51.28 
 
 		 932 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 934 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 921 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 934 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 931 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 931 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 934 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  57.58 
 
 		 900 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 932 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 916 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 913 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  53.12 
 
 		 1004 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  69.23 
 
 		 958 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0512  preprotein translocase, SecA subunit  73.91 
 
 		 931 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  58.62 
 
 		 1067 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1088  preprotein translocase subunit SecA  48.89 
 
 		 1024 aa  46.2  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442494  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  47.37 
 
 		 865 aa  46.2  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 893 aa  45.8  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 921 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  42.5 
 
 		 936 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 970 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  59.26 
 
 		 918 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  64 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 970 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 		 936 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 844 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21380  SEC-C motif-containing protein  59.26 
 
 		 665 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 953 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 946 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 947 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 946 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 951 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 898 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 950 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 907 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  59.26 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 936 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 970 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 946 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  38.3 
 
 		 1113 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 915 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 910 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 906 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 921 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 908 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  66.67 
 
 		 909 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 909 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 958 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 912 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  50 
 
 		 912 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 911 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1440  protein translocase subunit secA  44.44 
 
 		 937 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 903 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 908 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 904 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 910 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  62.96 
 
 		 908 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 904 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 904 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 907 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  51.61 
 
 		 834 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  66.67 
 
 		 901 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  60 
 
 		 923 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 901 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 905 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 907 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 909 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>