88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0215 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 318 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  60.53 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  59.21 
 
 		 292 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  46.34 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  51.51 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  46.56 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  46.2 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  44.34 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  44.3 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  46.08 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  40.58 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  41.45 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  45.99 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  42.09 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  45.02 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  40.62 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  36.84 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  40.52 
 
 		 274 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  37.69 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  35.69 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 997 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  51.16 
 
 		 971 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 896 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 932 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 896 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  42.86 
 
 		 863 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1857  preprotein translocase SecA subunit  39.29 
 
 		 955 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 971 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 962 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  42.5 
 
 		 844 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 944 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  72.22 
 
 		 909 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 962 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  72.22 
 
 		 909 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  43.24 
 
 		 906 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0891  SecC motif-containing protein  52.94 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  70 
 
 		 962 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  70 
 
 		 955 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 932 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  55.56 
 
 		 900 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 932 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 932 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 932 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  72.22 
 
 		 916 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 907 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4277  preprotein translocase, SecA subunit  45 
 
 		 1075 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  73.68 
 
 		 963 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 907 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 911 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  41.3 
 
 		 949 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  62.07 
 
 		 1018 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 907 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  72.22 
 
 		 916 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 909 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 908 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 933 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  59.26 
 
 		 868 aa  43.1  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  45.71 
 
 		 931 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  51.52 
 
 		 865 aa  43.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 903 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0685  preprotein translocase, SecA subunit  52 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 893 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  44.74 
 
 		 931 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  47.22 
 
 		 930 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  59.09 
 
 		 902 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 911 aa  42.7  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 968 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  70.59 
 
 		 884 aa  42.7  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2505  preprotein translocase, SecA subunit  42.55 
 
 		 981 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 936 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 907 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 908 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 904 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 904 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  70 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 904 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>