133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0237 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 311 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  51.06 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  54.75 
 
 		 312 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  52.22 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  56.57 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  51.84 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  52 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  48.36 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  47.81 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  53.09 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  46.52 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  42.91 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  49.08 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  40.06 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  46.18 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  42.19 
 
 		 390 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  46.49 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  45.29 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  41.44 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  41.7 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 906 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 906 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  54.84 
 
 		 911 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 903 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  54.84 
 
 		 970 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 911 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3982  preprotein translocase SECA subunit  53.12 
 
 		 899 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0777  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 933 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648887  normal  0.618411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  45 
 
 		 902 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  48.57 
 
 		 910 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  47.73 
 
 		 955 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  55.56 
 
 		 971 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1021  preprotein translocase subunit SecA  51.43 
 
 		 906 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 997 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  52.63 
 
 		 949 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  60.71 
 
 		 914 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  48.57 
 
 		 947 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 939 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  52.78 
 
 		 971 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 905 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  60.71 
 
 		 914 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 905 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  54.84 
 
 		 958 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0390  preprotein translocase subunit SecA  48.48 
 
 		 953 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7588  preprotein translocase subunit SecA  51.61 
 
 		 950 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.334261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 909 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  62.5 
 
 		 903 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  56.67 
 
 		 935 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  53.12 
 
 		 963 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  48.48 
 
 		 951 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 910 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0511  preprotein translocase subunit SecA  55.17 
 
 		 946 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  48.39 
 
 		 844 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  51.61 
 
 		 970 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  55.17 
 
 		 946 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  51.61 
 
 		 970 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  51.61 
 
 		 958 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 904 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 930 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 916 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 907 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2761  preprotein translocase subunit SecA  57.14 
 
 		 906 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 909 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2016  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 925 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 916 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  65.38 
 
 		 669 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  58.06 
 
 		 858 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 932 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  57.69 
 
 		 956 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 912 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 910 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1169  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 908 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 930 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 915 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 907 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0299  preprotein translocase subunit SecA  45.45 
 
 		 946 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0274  preprotein translocase subunit SecA  51.72 
 
 		 926 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2831  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 908 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.125346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 907 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 908 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 907 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 914 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 914 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  57.58 
 
 		 936 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 911 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 897 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  65.38 
 
 		 935 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0249781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>