20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4516 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  609  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  86.45 
 
 		 309 aa  524  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  56.27 
 
 		 295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  54.61 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  51.11 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  44.34 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  47.84 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  52.73 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  49.63 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  44.19 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  47.6 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  47.79 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  44.55 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  44.85 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  41.91 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  42.59 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  41.18 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  39.89 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  38.44 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  39.13 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>