194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0162 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  54.29 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  53.77 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  46.73 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  46.56 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  46.88 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  50.18 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  44.92 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  42.24 
 
 		 390 aa  202  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  45.96 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  46.15 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  45.9 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  45.22 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  41.39 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  44.41 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  41.26 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  38.28 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  42.65 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  43.66 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  39.46 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  56.1 
 
 		 949 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  58.62 
 
 		 902 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  51.16 
 
 		 955 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  53.12 
 
 		 884 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  63.33 
 
 		 909 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 914 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  65.52 
 
 		 914 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 844 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  50 
 
 		 945 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 958 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  54.29 
 
 		 893 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 896 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 898 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  69.57 
 
 		 963 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 970 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 906 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 896 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 958 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 956 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 970 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  69.57 
 
 		 906 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  68.18 
 
 		 900 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 970 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  55.56 
 
 		 917 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  52.38 
 
 		 962 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3831  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 905 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  52.38 
 
 		 962 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3540  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 905 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  52.38 
 
 		 962 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 910 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 906 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  64 
 
 		 915 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 899 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  62.5 
 
 		 939 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  71.43 
 
 		 909 aa  46.2  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 903 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0485  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 951 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  65.38 
 
 		 944 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  64.29 
 
 		 909 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 897 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  71.43 
 
 		 903 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  56.67 
 
 		 896 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 917 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  50 
 
 		 908 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 907 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 904 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1420  protein translocase subunit SecA  50 
 
 		 935 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0249781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 904 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3982  preprotein translocase SECA subunit  69.57 
 
 		 899 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  72.73 
 
 		 863 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  54.55 
 
 		 902 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  57.69 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 904 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  61.54 
 
 		 901 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 868 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 934 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  60.71 
 
 		 904 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0530  preprotein translocase subunit SecA  59.38 
 
 		 946 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0526  preprotein translocase subunit SecA  68.18 
 
 		 947 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723301  normal  0.383723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 931 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 916 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 932 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  50 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 908 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 922 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 921 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 917 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>