20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3190 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  63.27 
 
 
275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  55.11 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  59.07 
 
 
278 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  59.71 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  50.37 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  47.37 
 
 
327 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  49.45 
 
 
309 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  40.69 
 
 
308 aa  205  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  50.18 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  45.05 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  46.49 
 
 
311 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  42.7 
 
 
292 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  43.01 
 
 
312 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  41.16 
 
 
321 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  42.46 
 
 
390 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  39.64 
 
 
314 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  41.48 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  33.22 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  33.21 
 
 
298 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>