More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4729 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4729  oxidoreductase  100 
 
 
237 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5771  oxidoreductase  98.73 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4505  oxidoreductase  98.31 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04116  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  97.89 
 
 
237 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  97.47 
 
 
237 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3763  oxidoreductase  97.47 
 
 
237 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4835  oxidoreductase  97.47 
 
 
237 aa  460  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04080  hypothetical protein  97.89 
 
 
237 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4821  oxidoreductase  97.47 
 
 
237 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1798  oxidoreductase  82.28 
 
 
237 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0401257  normal  0.0380539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1657  oxidoreductase  81.86 
 
 
237 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1800  oxidoreductase  81.43 
 
 
237 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.419385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  81.43 
 
 
237 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  81.43 
 
 
237 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0085  oxidoreductase  78.9 
 
 
237 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.689145  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2966  oxidoreductase  61.04 
 
 
237 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.959173  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.26 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.05 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.44 
 
 
249 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.85 
 
 
248 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.62 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
249 aa  225  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49.38 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.03 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5033  short chain dehydrogenase  51.03 
 
 
253 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
246 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  47.13 
 
 
247 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2813  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.27 
 
 
254 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.09 
 
 
249 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.09 
 
 
249 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.68 
 
 
249 aa  204  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02300  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.31 
 
 
250 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257704  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.68 
 
 
249 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0262  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.95 
 
 
250 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.520001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3874  short chain dehydrogenase  46.31 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122974  normal  0.933314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  46.09 
 
 
247 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
246 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
261 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
243 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37322  normal  0.510566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
255 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
247 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
246 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
246 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202973  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
251 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
251 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
251 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
250 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
246 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
246 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
246 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881664  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
248 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424016  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
246 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
245 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
247 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
246 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
253 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
249 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  41.18 
 
 
243 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
245 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  41.28 
 
 
243 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
246 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
242 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
248 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332665  normal  0.273672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
246 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
246 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521218  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2664  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  38.8 
 
 
255 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
255 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
248 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.397771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
248 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
254 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
246 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
250 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
247 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40 
 
 
234 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.26 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
247 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.63 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0813  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.87 
 
 
251 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11512  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase fabG1  35.59 
 
 
247 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.298688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
249 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>