189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0521 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0521  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  100 
 
 
318 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1239  NQR2 and RnfD family protein  62.34 
 
 
320 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0582  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  51.42 
 
 
319 aa  325  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1959  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  48.73 
 
 
318 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.685679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2829  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.38 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00299909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0262  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfD subunit-like  38.53 
 
 
334 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0305  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  37.89 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0529  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  39.48 
 
 
315 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1156  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.62 
 
 
324 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0080  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.44 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0300271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0687  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.43 
 
 
355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0388  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.33 
 
 
325 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1311  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.29 
 
 
330 aa  159  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1326  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32 
 
 
325 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000145207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0987  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.31 
 
 
324 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.379961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0611  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.84 
 
 
326 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.798046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2022  electron transport complex protein RnfD  30.35 
 
 
351 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14340  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.57 
 
 
307 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000923733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2322  electron transport complex protein RnfD  30.23 
 
 
351 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1530  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.19 
 
 
331 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0274515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2629  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.93 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0307  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.45 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0928728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2821  electron transport complex, D subunit  31.2 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2237  electron transport complex protein RnfD  29.02 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1572  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.51 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.732649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2010  electron transport complex protein RnfD  32.21 
 
 
364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.079391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2896  electron transport complex, D subunit  32.81 
 
 
343 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1160  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.93 
 
 
338 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1898  electron transport complex protein RnfD  32 
 
 
351 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000890803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2250  electron transport complex protein RnfD  31.93 
 
 
364 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000198545  normal  0.637976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1033  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.94 
 
 
343 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000831458  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1784  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.78 
 
 
349 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3195  RnfD protein  33.93 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2157  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.23 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.853366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1569  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.08013  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3934  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.93 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00796702  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2342  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0357526  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1838  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00396997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01600  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0343  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.05 
 
 
315 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01590  hypothetical protein  28.9 
 
 
352 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0216636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.84 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476973  normal  0.422477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2011  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.9 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000875517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1706  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1664  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.82 
 
 
326 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1819  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1999  electron transport complex protein RnfD  28.9 
 
 
352 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00297126  normal  0.240124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1554  electron transport complex protein RnfD  30.06 
 
 
352 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.52008  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1626  electron transport complex protein RnfD  30.06 
 
 
352 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  0.410442 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0064  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.24 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2968  electron transport complex protein RnfD  30.59 
 
 
357 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1082  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.07 
 
 
315 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1718  electron transport complex protein RnfD  29.77 
 
 
352 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1566  electron transport complex protein RnfD  29.77 
 
 
352 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.094034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2431  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  34.19 
 
 
321 aa  136  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000125331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1092  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.44 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.93 
 
 
360 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1833  electron transport complex protein RnfD  35.13 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.457327  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1793  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.28 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1886  electron transport complex protein RnfD  29.48 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115078  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50950  Electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.74 
 
 
366 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0710127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1818  electron transport complex protein RnfD  28.82 
 
 
350 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452065  decreased coverage  0.000391515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2559  electron transport complex protein RnfD  30.47 
 
 
350 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0735  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.32 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.170289  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002946  electron transport complex protein RnfD  31.45 
 
 
348 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19240  Electron transport complex, subunit D  31.89 
 
 
343 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2511  electron transport complex protein RnfD  30.09 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4510  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.07 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000355636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02967  electron transport complex protein RnfD  30.74 
 
 
328 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2196  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.44 
 
 
353 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0679  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32 
 
 
318 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0703  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32 
 
 
318 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2171  electron transport complex protein RnfD  31.18 
 
 
349 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0839879  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1401  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2067  electron transport complex protein RnfD  30.88 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0541155  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1908  electron transport complex protein RnfD  30.88 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1542  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  29.12 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.142338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2276  electron transport complex protein RnfD  28.87 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.034866  normal  0.800478 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4548  electron transport complex protein RnfD  29.79 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2262  electron transport complex protein RnfD  29.79 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1172  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  32.93 
 
 
345 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2109  electron transport complex protein RnfD  29.79 
 
 
349 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2698  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.64 
 
 
338 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0784392  normal  0.0118792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18910  hypothetical protein  33.66 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00596612  normal  0.053372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2062  electron transport complex protein RnfD  29.79 
 
 
349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000244661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2992  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  33.94 
 
 
357 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1866  electron transport complex protein RnfD  29.88 
 
 
350 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1847  electron transport complex protein RnfD  28.91 
 
 
349 aa  125  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000941791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0535  electron transport complex protein RnfD  28.41 
 
 
348 aa  125  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0286  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  31.66 
 
 
357 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2175  electron transport complex protein RnfD  27.78 
 
 
350 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.164146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2041  electron transport complex protein RnfD  27.51 
 
 
350 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.460383  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2356  electron transport complex protein RnfD  29.43 
 
 
350 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1062  electron transport complex protein RnfD  26.15 
 
 
363 aa  123  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1869  electron transport complex protein RnfD  28.41 
 
 
351 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02732  electron transport complex protein RnfD  30.26 
 
 
342 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1734  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.2 
 
 
361 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0495  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28.89 
 
 
308 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00551024  hitchhiker  0.00264587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3235  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30.33 
 
 
338 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.467841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0935  electron transport complex protein RnfD  32.65 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.495036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>