More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0160 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  577  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.193009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.83 
 
 
286 aa  315  6e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0893446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
284 aa  295  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
284 aa  295  8e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 
284 aa  294  9e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.92 
 
 
283 aa  280  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.639488  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.25 
 
 
286 aa  278  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.386842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
289 aa  275  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.709425  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
285 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
291 aa  248  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
285 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37266  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.54 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
273 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
282 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
285 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.7 
 
 
727 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
277 aa  155  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
274 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
280 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0346829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
320 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0547  peptide ABC transporter, protein inner membrane binding component  31.68 
 
 
327 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
334 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
331 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  33.62 
 
 
341 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
331 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  28.94 
 
 
341 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  31.75 
 
 
638 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.78 
 
 
311 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
300 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 
279 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
288 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
279 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  33.77 
 
 
341 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7458  peptide ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340693  normal  0.469526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
280 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20160  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  35.11 
 
 
621 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.533008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  32 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6186  ABC transporter related  31.16 
 
 
590 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
303 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
350 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0147  peptide ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
341 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.10252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
358 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21760  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.72 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0612673  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  31.21 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
309 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00634879  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.876873  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.771808  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  32.3 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
309 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.35 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00436739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2743  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
302 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418739  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
314 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
302 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  29.79 
 
 
304 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
307 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
311 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
277 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  30.28 
 
 
307 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.28 
 
 
307 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  29.93 
 
 
307 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
306 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
306 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
468 aa  122  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
325 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.854176  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
276 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176316  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  30.89 
 
 
269 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
291 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  30.63 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0964586  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.44 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.02 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  28.83 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
300 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  27.08 
 
 
283 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  27.08 
 
 
283 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
309 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
307 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
304 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
464 aa  116  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06410  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.73 
 
 
320 aa  115  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.138967  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  32.02 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>