269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1593 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1593  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0447  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.84 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  34.85 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  38.39 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  37.1 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.47 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  37.5 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  39.82 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3411  NifU domain-containing protein  33.59 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.27 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  38.6 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  36.28 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  33.63 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.28 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  38.33 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  37.17 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.4 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.64 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.71 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  39.45 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.84 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.25 
 
 		 284 aa  80.5  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  36.84 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.93 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.74 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.93 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.93 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.4 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.11 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  35 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0579  NifU domain-containing protein  32.8 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.503517 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.04 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.21 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  37.39 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.52 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.19 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.17 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.07 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.61 
 
 		 281 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  36.84 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  35.34 
 
 		 291 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.34 
 
 		 291 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  36.75 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  40 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.78 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  41.03 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  29.2 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  29.63 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.5 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.02 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.5 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.02 
 
 		 294 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  36.44 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  40.17 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  36.75 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.55 
 
 		 329 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.19 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  40.17 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  37.84 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  40.34 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  37.72 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.82 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.34 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1459  scaffold protein  36.75 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0275409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2265  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  28.32 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  38.46 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  36.44 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  38.66 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1740  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1820  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00411311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  38.98 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2279  scaffold protein  35.59 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0078288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  38.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  41.96 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.09 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  37.93 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  38.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.66 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  38.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  38.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  38.14 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  37.82 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  35.34 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.43 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.75 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>