176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3411 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3411  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  319  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0447  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.09 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1593  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.59 
 
 		 143 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  37.04 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  33.64 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.31 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.11 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.3 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  28.68 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  35.78 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  32.52 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  29.73 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.31 
 
 		 284 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.31 
 
 		 284 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.75 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0579  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.503517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.48 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.64 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.41 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  32.41 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  31.86 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  29.36 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.48 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  27.27 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.66 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  28.24 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  28.44 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.53 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.58 
 
 		 300 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.36 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.23 
 
 		 286 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  28.23 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.93 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.43 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  28.7 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  28.7 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  32.14 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  27.72 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  31.25 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2651  nitrogen-fixing NifU-like  31.96 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.55 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  30.91 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  30.91 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  30.91 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  32.73 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.25 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  32.14 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  25.88 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.25 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  25 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  29.09 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  28.68 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  32.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.12 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  31.25 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.21 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  26.85 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  29.47 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0318  NifU domain-containing protein  33.72 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550204  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  30 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  30.91 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  30 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  29.46 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.53 
 
 		 306 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  29.73 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  30.09 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  31.25 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  30.09 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  31.82 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  30.91 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  30 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0302  scaffold protein  30.71 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.44 
 
 		 277 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  30.91 
 
 		 291 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.91 
 
 		 291 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.53 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  26.96 
 
 		 284 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.74 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  29.57 
 
 		 312 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>