200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0318 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0318  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 105 aa  218  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0579  NifU domain-containing protein  46 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.503517 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  36.19 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.87 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  35.48 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  36.26 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.87 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.04 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  39.08 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  34.38 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  34.29 
 
 		 211 aa  60.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  35.87 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.61 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.29 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  37.11 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  35.58 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  35.05 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  34.44 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  33.33 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.56 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  34.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  36.67 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  34.12 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  33.7 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  35.56 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  35.56 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  33.7 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  33.7 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  33.7 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  35.87 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  33.7 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  35.87 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.36 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  35.87 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.94 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  36.26 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  35.87 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  36.67 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  35.87 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  33.7 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  34.44 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  37.21 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  35.87 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  35.87 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  36.26 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  35.87 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0869  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.05 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.11 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  35.56 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  31.11 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  36.67 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  32.61 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  35.16 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.47 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  32.61 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.12 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  32.67 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  35.56 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  34.07 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.33 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  35.56 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  35.56 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  34.44 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.22 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  32.08 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  35.56 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.33 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  32.04 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  35.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  35.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3411  NifU domain-containing protein  33.72 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  36.78 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  35.56 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  32.94 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  33.7 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.72 
 
 		 298 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  33.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  34.78 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  33.7 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.33 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.22 
 
 		 286 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  35.48 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  32 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>