248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0579 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0579  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  296  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.503517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0318  NifU domain-containing protein  46 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550204  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  34.96 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  36.21 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1593  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.8 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  33.03 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.58 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  38 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  35.35 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  39.58 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.78 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  33.96 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.38 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  34.82 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  32.41 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.51 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0447  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.23 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  33.67 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  33.67 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  30.84 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  25.42 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.27 
 
 		 284 aa  62  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  33.67 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3411  NifU domain-containing protein  37.5 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  35.79 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.45 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  35.9 
 
 		 211 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.99 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  32.99 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.84 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.76 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.36 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  36.36 
 
 		 312 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.23 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.49 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.23 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.5 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.36 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  37.5 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.33 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.23 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  35.05 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  32.98 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.89 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.77 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.88 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.33 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.61 
 
 		 298 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.03 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  34.78 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.09 
 
 		 306 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.57 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.51 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  36.78 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.23 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.44 
 
 		 286 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  31.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  34.44 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  33.7 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.68 
 
 		 309 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  31.71 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.23 
 
 		 290 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  36 
 
 		 344 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  34.38 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.22 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  36.78 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.52 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  35.63 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  35.63 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  33.62 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  35.63 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.68 
 
 		 300 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  32.76 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>