287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0447 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0447  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1593  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3411  NifU domain-containing protein  36.09 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  34.48 
 
 
122 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0595  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.89 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  37.04 
 
 
129 aa  84  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.45 
 
 
150 aa  84  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.68 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.21 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.96 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  34.96 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.59 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  33.9 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  35.34 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.83 
 
 
284 aa  77.8  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  34.19 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.36 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  36.21 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.95 
 
 
286 aa  77  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.71 
 
 
277 aa  77  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.71 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  31.9 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.25 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  33.62 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.36 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.51 
 
 
284 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.51 
 
 
284 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.05 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  31.67 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  31.03 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  35.77 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.9 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.13 
 
 
211 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  34.71 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  32.76 
 
 
173 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  31.36 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  36.27 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0630  scaffold protein  33.85 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.02 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.17 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  32.08 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.73 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.83 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.81 
 
 
309 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  33.33 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  30.17 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.51 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.51 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  30.51 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  28.45 
 
 
129 aa  67  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  33.64 
 
 
290 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.51 
 
 
344 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  29.91 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.57 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  28.81 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  31.62 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.06 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  28.81 
 
 
329 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0579  NifU domain-containing protein  37.23 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.503517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  30.33 
 
 
211 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  29.06 
 
 
280 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.7 
 
 
288 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.9 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  26.5 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0869  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.6 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  26.67 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.46 
 
 
203 aa  60.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  29.51 
 
 
203 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.13 
 
 
306 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  27.12 
 
 
312 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.42 
 
 
298 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.42 
 
 
309 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.52 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  25.64 
 
 
278 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  27.87 
 
 
203 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.35 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  27.35 
 
 
281 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.2 
 
 
203 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  26.4 
 
 
203 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.98 
 
 
200 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  24.6 
 
 
277 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0021  NifU-like protein  29.66 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.13876e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  31.97 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  29.75 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  32.23 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  31.97 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.05 
 
 
203 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.27 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  30.33 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.05 
 
 
203 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  31.97 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  38.27 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  28.93 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1354  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  30.51 
 
 
488 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  30.89 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28374  iron-sulphur assembly protein isc  27.07 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.13011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  33.06 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  28.93 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  29.27 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>