More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2590 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 
526 aa  1083    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  55.36 
 
 
640 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  52.44 
 
 
630 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  73.52 
 
 
609 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  50.57 
 
 
264 aa  270  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4636  hypothetical protein  68.25 
 
 
170 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733458  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  59.87 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  40.27 
 
 
288 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  38.91 
 
 
288 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  50.45 
 
 
359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  46.9 
 
 
505 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  45.79 
 
 
373 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  37.74 
 
 
1064 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  43.24 
 
 
592 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  45.54 
 
 
561 aa  91.3  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  39.23 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  40 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  37.69 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  37.69 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  43.14 
 
 
527 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  43 
 
 
472 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  40 
 
 
576 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  37.74 
 
 
478 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  33.12 
 
 
459 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  35.1 
 
 
462 aa  86.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  37.82 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  41.82 
 
 
656 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  44.9 
 
 
565 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  36.15 
 
 
449 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  35.88 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  41.44 
 
 
621 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  38.6 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  36.92 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  40.4 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  36.97 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  35.12 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  43.56 
 
 
589 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  39.02 
 
 
633 aa  85.1  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  36.15 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  37.69 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  37.69 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  33.54 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  36.15 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  39.02 
 
 
640 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  36.92 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  40.91 
 
 
598 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  39.02 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  33.61 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  44.94 
 
 
606 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  31.98 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  33.54 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  36.15 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  39.02 
 
 
630 aa  84.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  36.97 
 
 
474 aa  84  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  34.62 
 
 
455 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  43.14 
 
 
637 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  37.69 
 
 
462 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  35.77 
 
 
477 aa  84  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  36.15 
 
 
470 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  45.98 
 
 
446 aa  84  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  44.94 
 
 
607 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  40.91 
 
 
626 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  44.94 
 
 
638 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  44.83 
 
 
467 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  38.28 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2456  multicopper oxidase type 3  38.84 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  44.83 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  38.66 
 
 
431 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  38.66 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  37.4 
 
 
476 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  45.26 
 
 
564 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  37.74 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  36.15 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  38.66 
 
 
431 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  42.31 
 
 
871 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  42.27 
 
 
514 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  36.92 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  38.6 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  42.57 
 
 
592 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  44.19 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  36.97 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  38.6 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  42.05 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  41.9 
 
 
746 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  40.78 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  38.6 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  36.92 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  37.61 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  46.34 
 
 
556 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  34.31 
 
 
431 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  36.92 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  41.58 
 
 
621 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06635  Laccase-1 Precursor (EC 1.10.3.2)(Laccase I)(Benzenediol:oxygen oxidoreductase 1)(Urishiol oxidase 1)(Diphenol oxidase 1)(Conidial laccase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17489]  46.99 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.908063  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  39.09 
 
 
631 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  39.09 
 
 
631 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  39.09 
 
 
590 aa  80.9  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  44.79 
 
 
664 aa  80.9  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  44.79 
 
 
666 aa  80.9  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  34.65 
 
 
809 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>