18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0051 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0051  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0049  hypothetical protein  96.88 
 
 
288 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2559  hypothetical protein  40 
 
 
264 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.777014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  37.67 
 
 
640 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2590  multicopper oxidase, type 3  38.91 
 
 
526 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.238338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  39.66 
 
 
609 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  40.77 
 
 
630 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4636  hypothetical protein  43.55 
 
 
170 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33040  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0025  hypothetical protein  27.86 
 
 
202 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0014866  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6368  integral membrane protein  27.56 
 
 
221 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3047  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0682025  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2715  hypothetical protein  28.77 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.51319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0783  hypothetical protein  24.82 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4734  hypothetical protein  23.74 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1521  hypothetical protein  25.9 
 
 
217 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427977  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0105  integral membrane protein  31.43 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.74446 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4590  hypothetical protein  22.97 
 
 
191 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>