More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1329 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
328 aa  671    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0225726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1459  hypothetical protein  89.6 
 
 
329 aa  614  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.487858  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0056  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
329 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262726  decreased coverage  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4808  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  36.2 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.47 
 
 
300 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305882  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.6 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  25.15 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  23.26 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  25.84 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.02 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.04 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  24.04 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.74 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  24.55 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.54 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  30.27 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  23.44 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  23.44 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  23.44 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  27.22 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  24.62 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  22.32 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  22.32 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  22.32 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  24.62 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  24.92 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  23.87 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  24.92 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.19 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.32 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1754  UDP-glucose 4-epimerase, putative  27.59 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0706021  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  22.19 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.72 
 
 
327 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  22.02 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5276  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.6 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.02 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61280  putative epimerase  25.91 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0023317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  22.67 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  22.02 
 
 
336 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  22.49 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.26 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
321 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  23.05 
 
 
341 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  26.52 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  23.05 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  26.28 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  26.67 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
506 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1335  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.91 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0357756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  24.32 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.19 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>